Beyond Independent Genes: Learning Module-Inductive Representations for Single-Cell Gene Perturbation Prediction
超越独立基因:学习模块归纳表示用于单细胞基因扰动预测
机构 * The State Key Lab of Brain-Machine Intelligence, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang, China(脑机智能国家重点实验室,浙江大学,杭州,浙江省,中国) ; ReLER Lab, College of Artificial Intelligence, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang, China(ReLER实验室,人工智能学院,浙江大学,杭州,浙江省,中国) ; Department of Biomedical Informatics, Harvard Medical School, Boston, MA, USA(生物医学信息学系,哈佛医学院,波士顿,马萨诸塞州,美国)
AI总结 提出scBIG框架,通过基因关系聚类、基因簇感知编码器和结构感知对齐学习协调的基因程序模块表示,结合条件流匹配实现灵活泛化的扰动预测,在多个单细胞扰动基准上平均提升6.7%。