scShapeBench: Discovering geometry from high dimensional scRNAseq data
scShapeBench: 从高维scRNAseq数据中发现几何结构
机构 * Yale University(耶鲁大学) ; Mila / Université de Montréal(Mila / 蒙特利尔大学) ; Garvan Institute of Medical Research(Garvan医学研究机构) ; School of Biomedical Sciences, University of New South Wales(新南威尔士大学生物医学科学学院) ; University of Wisconsin–Madison(威斯康星大学麦迪逊分校)
AI总结 scShapeBench通过合成和专家标注的单细胞数据集,提供高维数据形状检测的基准,结合扩散几何提取Reeb图,改进拓扑-aware评估指标,优于PAGA和Mapper。