A vision foundation model for single-cell biology via spatial gene cartography
通过空间基因制图构建单细胞生物学的视觉基础模型
机构 * Stanford University(斯坦福大学) ; Stanford University School of Medicine(斯坦福大学医学院)
AI总结 研究提出scVision视觉基础模型,利用最优传输将基因布局成图像,通过掩码图像建模预训练视觉Transformer。该模型在零样本评估中表现出色,能无监督恢复基因程序,在多研究整合中效果好,还证明基因布局位置携带信号,重塑单细胞表示学习为视觉问题。
Comments 54 pages, 34 figures, 10 tables, including supplementary information. Project page: https://islamlab.org/scvision