医学 AI

Chem2Gen-Bench: Benchmarking Chemical-to-Genetic Translation in Perturbation Response Space

Chem2Gen-Bench：在扰动响应空间中评估化学到遗传的翻译

Yuxiang Lin, Ying Chen

机构 * National Institute for Data Science in Health and Medicine, Xiamen University（厦门大学健康医疗大数据国家研究院） ； School of Informatics, Xiamen University（厦门大学信息学院） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)；分类 cs.LG

AI总结 提出Chem2Gen-Bench基准，包含26万化学和110万遗传扰动谱，评估化学与遗传扰动在共享靶点下的对齐与翻译保真度，发现背景调整可提高相似性但降低检索成功率，基础模型嵌入未一致优于基线。

The Critical Role of Model Selection in Causal Inference: A Comparative Analysis of Classification Models within the InferBERT Framework for Pharmacovigilance

模型选择在因果推断中的关键作用：基于InferBERT框架的药物警戒分类模型比较分析

Csaba Kiss, Roland Molontay, Gabriele Pergola

机构 * Department of Stochastics, Institute of Mathematics, Budapest University of Technology and Economics（布达佩斯技术与经济大学数学研究所随机学系） ； Institute of Biostatistics and Network Science, Semmelweis University（塞梅维什大学生物统计学与网络科学研究所） ； Department of Computer Science, University of Warwick（华威大学计算机科学系） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)；分类 cs.LG

AI总结 本研究在InferBERT框架下比较XGBoost、ALBERT、BioBERT和Med-LLaMA四种模型，发现领域特定预训练（BioBERT）在药物警戒因果ADE检测中优于简单基线和大型LLM，校准改善ECE但对准确率和因果发现影响不一。

Comments 10 pages, 5 figures

Adaptive Derivative Estimation via Stein's Unbiased Risk

基于Stein无偏风险的自适应导数估计

Yonathan Murin, Ali Ozer Ercan

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)；分类 eess.SP

AI总结 提出SURDE方法，通过Stein无偏风险评估候选滤波器长度并软组合输出，实现因果FIR导数滤波的噪声-偏差权衡，证明极小极大最优性，在仿真和真实数据上优于ICI和AWVE。

Comments Submitted to IEEE Transactions on Signal Processing, 23 pages

AAbAAC: An Annotated Corpus for Autoimmunity Information Extraction

AAbAAC：用于自身免疫信息抽取的标注语料库

Fabien Maury, Solène Grosdidier, Maud de Dieuleveult, Adrien Coulet

机构 * Inserm, Université Paris Cité, U1163 Institut Imagine（法国国家健康与医学研究院、巴黎西岱大学、U1163 想象研究所） ； Inria, Inserm, Université Paris Cité, U1346 HeKA（法国国家信息与自动化研究所、法国国家健康与医学研究院、巴黎西岱大学、U1346 HeKA） ； Freelance researcher（自由研究员） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract,journal_ref)

AI总结 针对自身免疫领域信息抽取性能不足，构建了包含115篇PubMed摘要的AAbAAC语料库，手动标注实体和关系，通过微调NER模型验证了其有效性。

Journal ref BioNLP 2026 - 25th Workshop on Biomedical Natural Language Processing, ACL, Jul 2026, San Diego (CA), United States

EpiBench: Can LLMs Understand Epitopes for Antibody Drug Discovery?

EpiBench：大型语言模型能否为抗体药物发现表位？

Zirui Wang, Jiaqi Wang, Qinghan Wang, Yuzhi Xu, Gang Du, Tingjun Hou, Odin Zhang

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)；分类 q-bio

AI总结 本研究提出用于评估大型语言模型表位推理能力的基准EpiBench，发现现有通用LLMs在抗体药物发现相关表位推理上仍存局限，为改进序列感知型生物医学LLMs提供了测试平台。

Threat Vectors and the State of the Art in Defense Methods for Security in Neurotechnology

神经技术安全防御方法中的威胁向量与现状

Bryce-Allen Bagley, Nathaniel Rose, Quintus Kilbourn, Matthew Canham

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)；分类 q-bio

AI总结 本文针对脑机接口安全研发滞后问题，回顾神经安全技术现状，全面调查BCI系统安全威胁，给出可应用于弥补神经安全差距的现有方法建议，助力提升神经技术安全。

FastJM: An R Package for Efficient Implementation of Semiparametric Joint Models for Longitudinal and Survival Data

FastJM：用于高效实现纵向与生存数据半参数联合模型的R包

Shanpeng Li, Emily Ouyang, Ace Isabel Mejia-Sanchez, Xinping Cui, Gang Li

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 FastJM是用于高效实现三类半参数联合模型的R包，采用定制线性扫描算法解决计算瓶颈，提供统一接口支持模型相关操作及动态预测等功能。

Limitations of post accelerating ion beams using the snowplow field in a near-critical density target

近临界密度靶中利用雪犁场加速离子束的局限性

Davide Terzani, Stepan S. Bulanov, Lieselotte Obst-Huebl, Carlo Benedetti, Franklin Dollar, Eric Esarey, Axel Huebl, Aodhan McIlvenny, John Palastro, Jessica Shaw, Carl B. Schroeder, Douglass Schumacher, Mingsheng Wei, Louise Willingale

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本文探究级联离子加速方案，讨论将离子束加速扩展至相对论能量的可能性，指出激光驱动离子加速受带电粒子与强电磁场相互作用基本特性限制，该方案或为实现相对论能量提供途径。

SchemaLink: An Intelligent Web Editor for LinkML Schema Curation

SchemaLink：用于LinkML模式管理的智能Web编辑器

Emanuele Cavalleri, Paolo Perlasca, J. Harry Caufield, Justin Reese, Christopher J. Mungall, Marco Mesiti

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本文提出基于Web的SchemaLink，通过图形化语言和RAG方法简化LinkML模式的设计与管理，生成高质量模式，相关资源开源提供。

Research Assistant: AstraZeneca's Agentic System for R&D

研究助手：阿斯利康的研发智能体系统

Piotr Grabowski, Mohamed Alameen, Jorge Bretones, Sabina Cardell, Miguel Carmona, Gavin Edwards, Ben Grainger, Sameh Hassan, Erik Jansson, Artur Kuziakhmetov, Albert Maristany, Hebatallah Mohamed, Andriy Nikolov, Sebastian Nilsson, Mark O'Donoghue, James Pacileo, Ashiq Sultan, Alex Voegele, Michael Ughetto

机构 * AstraZeneca（阿斯利康） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 阿斯利康研发了基于LLM的智能体系统Research Assistant，整合多类生物医学数据，支持两种问答模式，可溯源证据，为研发工作提供支持。

Comments 16 pages, 3 figures

Characterizing Peace Through Scientific Keywords

通过科学关键词表征和平

Gita Ghiasi, Rabeeh Parhizkari, Tanja Tajmel

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本研究通过分析不同背景下SDG 16相关学术出版物的关键词差异，揭示和平概念在学科和国别间的不同表征，为研究重点和科学政策制定提供依据。

Apodex Discovery: Reality Benchmarks and Environments for Evaluating and Building Discoverative Artificial Intelligence

Apodex Discovery：用于评估和构建发现式人工智能的现实基准与环境

Brian Wang, Bin Feng, Xiaoman Pan, Chenyang An, Felix Liu, Tangqi Fang, Gongbo Sun, Lingfeng Shen, Ning Wang, Handuo Zhang, Feng Chen, Fuchao Yang, Xiang Wang, Jiacheng Lin, Siting Li, Zixuan Liu, Chi Han, Zhenhailong Wang, Kunlun Zhu, Lawrence Zhao, Yueqi Guo, Kailong Wen, Feng Xing, Yiling Guo, Lidong Bing, David Tan, Bo An, Heng Ji, Sheng Wang

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 Apodex Discovery是评估和构建发现式AI的框架，含三个核心组件，在AAV衣壳设计等任务中较现有方法取得性能提升，推动AI评估向可验证的真正发现研究发展。

Comments 85 pages, 9 figures, 38 tables

Magnetic active matter across scales

跨尺度的磁性活性物质

Francisca Guzmán-Lastra, Margaret Rosenberg, Marco Musacchio, Lorenzo Caprini, Hartmut Löwen

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本综述聚焦携带固有磁偶极矩的活性自推进粒子，调研跨尺度相关实验与理论，阐明偶极相互作用的作用，讨论相关模型与涌现现象，概述磁性活性系统的挑战与机遇。

Comparing Tobit and Two-Part Hurdle Models for Semi-Continuous Longitudinal Data with an Application to Clonal Hematopoiesis

Tobit模型与两部分Hurdle模型在半连续纵向数据中的比较及其在克隆性造血中的应用

Sumaja Bandreddi, Pei Zhang, Rebecca L. Kelly, Mitchell J. Machiela, Paul S. Albert

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本文比较了Tobit模型与两部分Hurdle模型，推导了二者等价的数学条件，通过模拟研究发现Hurdle模型更灵活稳健，将二者应用于克隆性造血研究，得到的结果与标准线性模型大致一致。

Direct Laser Interference Patterning of Functional Metal Surfaces: From Written Geometry to Functional Interfaces

功能金属表面的直接激光干涉图案化：从写入几何到功能界面

Petr Hauschwitz

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本综述以DLIP为模型系统，指出仅靠几何无法预测金属表面功能，需分离写入几何与形成的界面，明确跨领域变量可转移性，为DLIP表面工程提供预测框架。

Comments Review article, 6 figures, 2 tables

From Enumeration to Covering: Near-Optimal Densest P-Partite Subgraph Search over Large Heterogeneous Information Networks

从枚举到覆盖：大型异构信息网络上的近最优P部稠密子图搜索

Lu Chen, Chengfei Liu, Rui Zhou, Jiajie Xu, Jianxin Li

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本文针对异构信息网络的稠密P部子图问题，提出用覆盖替代枚举的自适应剥离算法，实现近最优近似比，在真实网络上较枚举方法大幅加速，可验证子图近最优性。

Acoustic-driven millimetric helical robot: ultrasonic synergistic manipulation in confined fluidic environment

声驱动毫米级螺旋机器人：受限流体环境中的超声协同操控

Hanlin Wang, Xin Wang, Xinwei Wei, Jiaxu Liu, Le Wang, Shengze Cai, Chao Xu

机构 * Zhejiang University（浙江大学） ； Huzhou Institute of Zhejiang University（浙江大学湖州研究院） ； Huzhou Normal University（湖州师范学院） ； Huzhou Vocational and Technical College（湖州职业技术学院） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 该研究提出协调多声场方法，利用声辐射力与声流协同实现毫米级螺旋机器人在受限流体环境的可控运动，提升了操控性，为相关生物医学应用提供支撑。

Multi-frequency far-field data enrichment for electromagnetic source reconstruction

用于电磁源重建的多频远场数据增强

Atyab Khalifa Al-Shaqsi, Heba Mohammed Al-Subhi, Xianchao Wang, Shujaat Khan, Abdul Wahab

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本文针对电磁源重建中多频远场数据欠采样的问题，提出基于ALOHA方法的两阶段数据增强策略，实现了高子采样率和强噪声下的准确稳定重建，性能优于标准ℓ₁压缩感知基线。

Comments 22 pages, 7 figures, 4 tables

High resolution meta-stereomicroscope based on birefringent meta-optics

基于双折射超构光学的高分辨率超构立体显微镜

Liheng Yan, Haowen Liang, Emiliano R. Martins, Yikun Liu, Tao Li, Thomas F. Krauss, Juntao Li, Xue-Hua Wang

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本文提出一种基于双折射超构光学的全超构立体显微镜，通过消除视场不匹配问题实现高横向（435 nm）与深度（1026 nm）分辨率成像，可应用于生物医学与工业检测领域。

Comments 14 pages, 5 figures

Breaking the trade-off between invisibility and sensitivity in electromagnetic sensing

打破电磁传感中隐身性与灵敏度之间的权衡

Yichao Liu, Jiaxue Zhou, Weifeng Han, Hanchuan Chen, Fei Sun, Qin Liao, Hengxiang Zhang, Xiaofan Ji, Yawen Qi

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 该研究通过集成变换光学架构设计多功能核壳结构，研制微波原型实现4.9-5.1 GHz内超3 dB散射抑制与六倍信号增强，解决了电磁传感隐身性与灵敏度的权衡问题，为弱信号检测提供新框架。

An Evidence-Grounded Retrieval-Augmented Transformer Framework for Health Misinformation Verification

用于健康虚假信息验证的基于证据的检索增强Transformer框架

Isah M. Bukar, Bala Mairiga Abduljalil, Bashir Saleh Maina, Abdulbasit Hassan

机构 * Yobe State University（约贝州立大学） ； Yobe AI Research Laboratory (YAIR Lab)（约贝人工智能研究实验室） ； Novosibirsk State University（新西伯利亚国立大学） ； College of Computer Science and Engineering, Hamad Bin Khalifa University（哈马德·本·哈利法大学计算机科学与工程学院） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本研究针对发展中国家健康虚假信息验证的本地语境缺失问题，提出基于WHO和尼日利亚疾控中心证据的检索增强Transformer框架，经实验评估BERT模型表现最佳，为资源受限地区开发相关系统提供基础。

Comments 17 pages, 2 figures, To appear in the Reimagining knowledge systems for digital transformation and sustainable development in the 21st century conference 2026, faculty of social sciences education. Federal University of Education, Zaria

Broadband Control of Light through Complex Media via Automatic Self-Referencing Transmission Matrix Characterisation

基于自动自参考传输矩阵表征的复杂介质宽带光控制

Marcos Maestre Morote, Mickael Mounaix, Andrew Komonen, Martin Plöschner, Joel Carpenter

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本文提出基于空间态层析的自动自参考传输矩阵测量技术，规避传统外部参考的限制，在多模光纤不同光源 regime 下实现完整传输矩阵恢复与高保真光束整形，拓展复杂介质光控制至宽带应用。

Comments Main text 13 pages, 4 figures. Supplementary Information 18 pages, 13 figures

The Continuous Latent Ornstein-Uhlenbeck Dynamics Framework: A Scalable Latent Process Model for Multivariate Longitudinal Categorical Data

连续潜变量奥恩斯坦-乌伦贝克动力学框架：面向多变量纵向分类数据的可扩展潜过程模型

Zhennan Wu, Yijie Wang, Xiaoqing Huang

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本文针对多变量纵向分类数据的分析挑战，提出CLOUD框架，结合IRT测量组件与时变OU过程，经模拟和ALS数据验证，可灵活刻画受试者特异性疾病演化。

Evaluating Agentic Bioinformatics through Function, Evidence, and Validation

通过功能、证据和验证评估智能体生物信息学

Phuc Pham, Truong-Son Hy

专题命中 生物医学文本 ：pathology(abstract)

AI总结 该研究提出FEV框架评估智能体生物信息学，梳理多领域128篇文献后发现规划等进展快于科学验证相关环节，主张应基于工作流正确性评估这类系统

Instability-induced bistable shape-morphing kirigami structures

不稳定性诱导的双稳态形状变形剪纸结构

Xiaoyuan Ying, Marcelo A. Dias

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 该研究提出逆向设计框架，通过几何失配与不稳定性实现各向异性双稳态剪纸结构的可编程形状变形，经模拟和实验验证，可集成于多种驱动系统，拓展工程应用

3D Uncertainty Quantification for the Photo-Acoustic Tomography

光声层析成像的三维不确定性量化

Babak Maboudi Afkham, Amal Mohammed A Alghami, Hassan Yazdanian, Tanja Tarvainen

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 研究光声层析成像的三维不确定性量化问题，提出有限元贝叶斯UQ框架，将RTO采样策略重构成无矩阵算法，通过构建特殊伴随离散化实现高效求解，经多种方法验证，可扩展到线性PDE约束反问题。

Enhanced abrupt autofocusing and depth-of-focus of circular Airy derivative beams via controlled asymmetry

通过可控不对称性增强圆形艾里导数光束的突然自聚焦和焦深

Anita Kumari, Vishwa Pal

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 研究通过可控不对称性增强圆形艾里导数光束的突然自聚焦和焦深，可使焦深大幅扩展、自聚焦能力提升，实验与模拟吻合良好，所产生的光束在多领域有应用前景。

Comments 7 pages, 10 figures

Dynamics of a microroller under confinement

受限微滚子的动力学

Han Gao, Nan Xie, Zaiyi Shen, Xiaoping Hu, Shiyuan Hu, Ye Xu

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 研究不同几何形状受限微通道中微滚子的动力学，结合实验、模拟和标度分析，发现收缩通道中微滚子速度变化规律，开发标度框架，揭示远场旋转流和近场剪切流对微滚子动力学的不同作用，为控制其动力学提供指导。

A 32-channel event-based bio-signal analog front-end with adaptive delta and pulse frequency encoding

一种具有自适应增量和脉冲频率编码的32通道基于事件的生物信号模拟前端

Narayanan Shyam, Saptarshi Ghosh, Giacomo Indiveri

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本文提出一种用于生物医学信号采集和编码的32通道基于事件的AFE专用集成电路，具有双模编码机制，aADM编码器可实时自适应调整编码数据速率，实现高数据压缩，为脑机接口神经信号自适应无线通信和在线处理提供支持。

Comments Submitted to NeuroPHY 2026 workshop, at the EWSN 2026 conference

Electrohydrodynamic wind generation in planar DBDs: role of electrode symmetry and geometry

平面介质阻挡放电中电液动力风的产生：电极对称性和几何形状的作用

Farshad Sohbatzadeh, Saeed Ranjbar Malekshah, Hamed Soltani Ahmadi, S Mirzanejhad, Ramin Mehrabifard, Samira Mavaddati, Zdenko Machala

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 研究大气压下SDBD等离子体致动器的EHD相互作用，用对称环形致动器表征离子风，研究电极直径和厚度对风速影响，实验与模拟结合，给出优化配置及最大风速，揭示离子风性能与副产物生成权衡，为相关应用提供指导。

Comments pages, 18 figures, 3 tables. Experimental and numerical study of vertical ionic-wind generation by an annular surface dielectric barrier discharge plasma actuator. Includes COMSOL plasma-fluid simulations, Schlieren flow visualization, Pitot-tube velocity measurements, and ozone measurements. Published in Physica Scripta

Journal ref Physica Scripta 101 (2026) 065601