医学 AI

Stabilizing In-Context Multi-Source Domain Adaptation for Biomedical Images Through Controls

通过上下文控制样本关闭生物医学成像中的领域差距

Ana Sanchez-Fernandez, Thomas Pinetz, Werner Zellinger, Günter Klambauer

机构 * ELLIS Unit Linz, LIT AI Lab ； Institute for Machine Learning, Johannes Kepler University Linz, Austria ； Medical University Vienna ； Clinical Research Center for Medical AI, Johannes Kepler University Linz, Austria 纠错

专题命中 生物医学文本 ：medical image(title,abstract)；biomedical(title,abstract)；分类 cs.LG、q-bio

AI总结 本文提出了一种通过负控制样本进行元学习适应的方法，用于解决生物医学成像中的领域差距问题，展示了在药物发现中的关键任务MoA分类中的有效性。

OpenBioRQ: Unsolved Biomedical Research Questions for Agents

OpenBioRQ: 未解决的生物医学研究问题

Minbyul Jeong

机构 * Upstage AI 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(title,abstract)

AI总结 提出OpenBioRQ基准，包含12,553个无答案的未解决生物医学问题，用于评估智能体在检索、忠实性和工具使用方面的能力，发现当前模型存在工具使用崩溃问题。

MedPath: Multi-Domain Cross-Vocabulary Hierarchical Paths for Biomedical Entity Linking

MedPath：用于生物医学实体链接的多领域跨词汇层次路径

Nishant Mishra, Wilker Aziz, Iacer Calixto

机构 * Department of Medical Informatics, Amsterdam UMC, University of Amsterdam, The Netherlands（阿姆斯特丹大学医学信息学系，阿姆斯特丹大学医学中心，荷兰） ； Amsterdam Public Health, Methodology, Amsterdam, The Netherlands（阿姆斯特丹公共卫生，方法学，阿姆斯特丹，荷兰） ； ILLC, University of Amsterdam, The Netherlands（阿姆斯特丹大学ILLC，荷兰） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(title,abstract)

AI总结 提出MedPath数据集，通过UMLS标准化、跨62个词汇表映射及完整本体路径增强，解决生物医学实体链接中的碎片化、可解释性不足和语义盲评估问题。

Comments Accepted at AACL-IJCNLP 2025(main)

Journal ref Proc. of IJCNLP-AACL 2025, pages 2959-2978, Mumbai, India

Chem2Gen-Bench: Benchmarking Chemical-to-Genetic Translation in Perturbation Response Space

Chem2Gen-Bench：在扰动响应空间中评估化学到遗传的翻译

Yuxiang Lin, Ying Chen

机构 * National Institute for Data Science in Health and Medicine, Xiamen University（厦门大学健康医疗大数据国家研究院） ； School of Informatics, Xiamen University（厦门大学信息学院） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)；分类 cs.LG

AI总结 提出Chem2Gen-Bench基准，包含26万化学和110万遗传扰动谱，评估化学与遗传扰动在共享靶点下的对齐与翻译保真度，发现背景调整可提高相似性但降低检索成功率，基础模型嵌入未一致优于基线。

MultiCNKG: Integrating Cognitive Neuroscience, Gene, and Disease Knowledge Graphs Using Large Language Models

MultiCNKG: 利用大语言模型整合认知神经科学、基因和疾病知识图谱

Ali Sarabadani, Kheirolah Rahsepar Fard

机构 * Department of Computer Engineering and Information Technology, University of Qom（卡姆大学计算机工程与信息科技系） ； University of Qom（卡姆大学） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)；分类 cs.LG

AI总结 本文提出MultiCNKG框架，整合认知神经科学、基因和疾病知识图谱，利用大语言模型实现实体对齐和图谱增强，提升生物医学领域知识图谱的整合与应用能力。

Journal ref Transactions on Machine Intelligence, 9(1), 1-15 (2026)

Beyond Data-Driven: How Physics-Informed Neural Networks are Reshaping Multi-Physics Design and Discovery

超越数据驱动：物理信息神经网络如何重塑多物理场设计与发现

Amir H. M. Labeb, Basmala Sallam, Abdelrahman W. Elsayed, Islam I. Abdulaal, Amany M. Kamal, Omar A. M. Abdelraouf

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本文综述了物理信息神经网络（PINNs）在多物理场建模中的最新进展，强调其通过将物理定律嵌入训练目标，实现数据高效、物理一致的前向建模、逆向设计和方程发现。

From Risk Sets to Martingales: A Counting-Process Framework for Event-History Learning

从风险集到鞅：事件历史学习的计数过程框架

Eliuvish Han Cui

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 提出统一计数过程框架，将删失、复发、多状态等事件历史数据转化为风险过程、跳跃过程、补偿子等五个对象，涵盖经典生存分析方法并给出计算、理论和应用三方面贡献。

Comments 144 pages, 43 figures, 9 tables

Brownian Motion with a Pulse: A Biostatistician's Guide to Diffusions, Bridges, Functional PCA, and First-Passage Models

带脉冲的布朗运动：生物统计学家指南——扩散、桥、函数主成分分析和首达时间模型

Eliuvish Han Cui

机构 * Department of Biostatistics, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, USA（加州大学洛杉矶分校生物统计学系） ； Kuntuo, an IQVIA company, China（IQVIA旗下公司Kuntuo，中国） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本文教程系统介绍布朗运动在生物统计中的应用，涵盖构造、路径性质、马尔可夫性、Karhunen-Loeve展开、函数主成分分析、反射原理、局部时、随机微分方程、布朗桥及经验过程极限，并通过纵向生物标志物、退化建模等实例展示其应用。

Comments 24 pages, 4 figures, 5 tables; tutorial article with a reproducible illustrative experiment