医学 AI

ChronoMedKG: A Temporally-Grounded Biomedical Knowledge Graph and Benchmark for Clinical Reasoning

ChronoMedKG：一个具有时间基础的生物医学知识图谱和用于临床推理的基准

Md Shamim Ahmed, Farzaneh Firoozbakht, Lukas Galke Poech, Jan Baumbach, Richard Röttger

机构 * University of Southern Denmark（丹麦南部大学） ； University of Hamburg（汉堡大学） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(title,abstract)

AI总结 本文提出ChronoMedKG，一个包含460,497个证据链接三元组的生物医学知识图谱，覆盖13,431种疾病，通过时间组件如发病窗口或进展阶段，为临床推理提供时间基础，并引入ChronoTQA基准测试，验证了其在时间推理任务中的有效性。

Comments 9 pages main text plus appendices, 8 figures. Dataset and benchmark paper. ChronoMedKG released under CC BY 4.0 and ChronoTQA/code under MIT (Zenodo: 10.5281/zenodo.19697542). Under review

BeLink: Biomedical Entity Linking Meets Generative Re-Ranking

BeLink: 生物医学实体链接结合生成性重新排序

Darya Shlyk, Stefano Montanelli, Lawrence Hunter

机构 * University of Milan（米兰大学） ； University of Chicago（芝加哥大学） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(title,abstract)

AI总结 本文提出了一种基于生成模型的重新排序方法，通过指令微调提高生物医学实体链接的效率和准确性，在多个基准测试中实现了3%-24%的链接准确率提升，同时减少了推理时间。

Comments Accepted to ACM SIGIR 2026

SepsisAI Orchestrator: A Containerized and Scalable Platform for Deploying AI Models and Real-Time Monitoring in Early Sepsis Detection

SepsisAI Orchestrator：一个容器化和可扩展的平台，用于部署AI模型和实时监控以实现早期败血症检测

Santiago Ospitia, John Sanabria, John Garcia-Henao

机构 * School of Systems Engineering and Computing, University of Valle（系统工程与计算学院，山谷大学） ； Digital Medicine Unit, Balgrist University Hospital（数字医学单元，巴尔格里斯大学医院） ； Nucleus-AI Research（核芯AI研究所） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：clinical AI(abstract)；分类 cs.LG

AI总结 本文提出SepsisAI-Orchestrator平台，通过整合HL7 FHIR启发的临床文档架构（CDA）预处理、NoSQL存储、容器化LightGBM分类器和Streamlit临床仪表板，解决了早期败血症检测中AI模型部署的挑战，并通过负载测试展示了U型扩展行为。

Comments 13 pages, 5 figures. Submitted to BioCARLA 2025 Workshop

Measuring Variable Importance in Heterogeneous Treatment Effects with Confidence

用置信度衡量异质处理效应中的变量重要性

Joseph Paillard, Angel Reyero Lobo, Vitaliy Kolodyazhniy, Bertrand Thirion, Denis A. Engemann

机构 * Roche Pharma Research \& Early Development, Roche Innovation Center Basel, F. Hoffmann-La Roche Ltd, Basel, Switzerland ； Université Paris-Saclay, Inria, CEA, Palaiseau, France 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)；分类 cs.LG

AI总结 本文提出PermuCATE算法，用于在估计条件平均处理效应时进行统计严谨的全局变量重要性评估，通过理论分析和实证研究证明其比LOCO方法具有更低的方差，从而提高统计功效，适用于生物医学应用中的有限数据环境。

Journal ref Proceedings of the 42nd International Conference on Machine Learning, PMLR 267:47456-47477, 2025

Wide-field mid-infrared edge-enhanced upconversion imaging

宽视场中红外边缘增强上转换成像

Mengyao Yu, Zhuohang Wei, Jianan Fang, Jixi Zhang, Tingting Zheng, Shina Liao, Kun Huang, Heping Zeng

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本文提出了一种宽视场中红外边缘增强上转换成像系统，结合涡旋泵复幅值工程与非周期准相位匹配，实现了高灵敏度和高空间带宽积的中红外成像，用于生物医学和材料检测。

Journal ref ACS Photonics 13, 991 (2026)

Biocompatible Microscale DNA Hydrogels with Programmable Swelling and Sequence-Specific Dissolution

具有可编程肿胀和序列特异性降解的生物相容性微米级DNA水凝胶

Corinna Torabi, Takayuki Suzuki, Emily Helm, Harrison Khoo, Sophie Tanenbaum, Rebecca Schulman, Soojung Claire Hur

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本文提出了一种生物相容且材料高效的微米级DNA水凝胶（microSDs）的制备与表征平台，通过可编程DNA设计参数实现可调的各向同性肿胀和降解特性，并利用YOYO-1定量提取有效扩散系数，研究肿胀对分子运输的影响，最终展示了微米级DNA水凝胶的降解行为及其在药物递送、多重生物传感和单细胞检测中的应用潜力。

STRUCTSENSE: A Task-Agnostic Agentic Framework for Structured Information Extraction with Human-In-The-Loop Evaluation and Benchmarking

STRUCTSENSE：一种任务无关的代理框架，用于结构化信息提取，具有人机协同评估和基准测试

Tek Raj Chhetri, Yibei Chen, Puja Trivedi, Dorota Jarecka, Saif Haobsh, Patrick Ray, Lydia Ng, Satrajit S. Ghosh

机构 * McGovern Institute for Brain Research, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, USA（麦戈文脑科学研究所，麻省理工学院，马萨诸塞州剑桥市） ； Fylo Labs Inc., New York, NY, USA（Fylo实验室公司，纽约州纽约市） ； Allen Institute for Brain Science, Seattle, WA, USA（艾伦脑科学研究所，华盛顿州西雅图市） 纠错

专题命中 生物医学文本 ：biomedical(abstract)

AI总结 本文提出STRUCTSENSE框架，通过整合本体引导的符号知识、代理自我评估细化和人机协同验证，实现了结构化信息提取的鲁棒性，并在三个领域展示了其跨任务泛化能力。

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