2602.04585
2026-05-15
cs.CV
ImmuVis: Hyperconvolutional Foundation Model for Imaging Mass Cytometry
Dawid Uchal, Marcin Możejko, Krzysztof Gogolewski, Piotr Kupidura, Szymon Łukasik, Jakub Giezgała, Tomasz Nocoń, Kacper Pietrzyk, Robert Pieniuta, Mateusz Sulimowicz, Michal Orzyłowski, Tomasz Siłkowski, Karol Zagródka, Eike Staub, Ewa Szczurek
发表机构
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Faculty of Mathematics, Informatics and Mechanics, University of Warsaw(数学与信息学学院,华沙大学)
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Merck Healthcare KGaA(默克健康护理公司)
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Institute of AI for Health, Helmholtz Munich(健康人工智能研究所,海德堡-穆恩)
AI总结
本文提出了一种名为 ImmuVis 的高效基础模型,专门用于成像质谱流式细胞术(IMC)数据的处理。该模型通过引入标记自适应超卷积,解决了IMC数据中通道不固定的问题,使得模型能够灵活处理不同研究中的标记组合。ImmuVis 在大规模数据集 IMC17M 上进行预训练,相比基于 Transformer 的方法具有更低的计算成本,并在虚拟染色和分类任务中表现出色,同时提供了校准的不确定性估计,为实际应用中的IMC建模提供了实用框架。